亚历克斯专门负责大型刑事案件的侦查和侦破。一名台湾女孩在一栋豪宅内遭受性虐杀，连同她的私人保镖等数人也都无一幸免，亚历克斯奉命接受此案的调查。而这起凶案似乎与环杀手迈克尔有关。他经验丰富、冷血残酷，总比警方快一步，每次犯案后都能顺利逃脱。为了挑衅亚历克斯，他在他们的结婚周年日给亚历克斯打了警告电话，并当着他的面杀死了他的妻子。亚历克斯失去妻子的痛苦，也激发他抓拿迈克尔的决心。而通过对虐杀案抽丝剥茧慢慢靠近谋杀案的真相时，重要的涉案关系人却一一遭到杀害。最后艾力克斯追寻到了一个只要你有钱任何梦想都可以实现的性爱乐园，而涉案人的政商关系好到简直令人匪夷所思的地步，如果案情爆开来世界将为之震动

主角工藤新一原本是一位颇具名声的高中生侦探，在目击黑衣组织的地下交易后，准备追踪时却被黑衣人琴酒袭昏，并被灌下代号为“APTX4869”（アポトキシン4869）的不明药物。后来虽然幸免于死，但身体就此缩小为小学时期的模样。之后他化名为江户川柯南，在好友阿笠博士的建议下，寄住在青梅竹马毛利兰的父亲－蹩脚侦探毛利小五郎家中，继续秘密从事追查黑暗组织的工作，并私下探寻获得解药的管道，希望能够恢复原来新一的样貌。与此同时，柯南凭著自己的推理天份，配合阿笠博士为他发明的道具，帮助毛利小五郎成为出名的大侦探。故事内容当中穿插许多爱情、友情、犯罪、背叛、复仇等情节。

冷战结束后，天控局面临被解散的危险，但是这个美国最大的特务机关，依旧担负着重要的使命。不过，近期天控局总部却遭受了突发性袭击，导致特工们都有被身份曝光的危险。其中也包括强壮如牛、身手不凡的23号特工。总部经过研究发现，袭击事件是一个叫盖不达集团的，为了迎敌，总部对分析家麦克斯韦委以重任，他终于等到了一展身手的机会。于是，他积极参与了对付盖不达的行动，不过之前的两次演习都被他搞砸了。唯一的收获是，他跟99号特工结成了搭档，后者是唯一不怕身份曝光的特工。他们在飞机上遇到了一个疑似的恐怖分子，但是当他们出手时，却意外陷入了对方的圈套。此后，这对欢喜冤家又接连遇到一系列令人啼笑皆非的困境……

《大侦探皮卡丘》的背景设定为人类与精灵宝可梦和平共处的一个世界，私家侦探Harry Goodman突然失踪，其子Tim（Justice Smith饰演）试图找到失踪的线索。Tim意外发现自己可以和皮卡丘进行沟通，并搭档大侦探皮卡丘一同调查父亲失踪之谜，最终发现一个足以毁掉整个精灵宝可梦宇宙的惊天阴谋。

本作改编自田中阳子和深泽将秀双人搭档所创作的绘本，以可爱的大头屁股侦探，与搭档小狗布朗一起，通过犯罪现场的一系列蛛丝马迹，推理追踪犯人的故事……