基努李维斯又带来了一部令人兴奋的电影。本片被许多影评人评为1999年最棒的科幻影片。 在不久的将来，一名年轻的网络黑客尼奥基努李维斯发现看似正常的现实世界实际上是由一个名为“矩阵”的计算机人工智能系统控制的，人们就象他放牧的动物一样。尼奥在网络上查找关于“矩阵”的一切。在。在一名神秘女郎特蕾妮嘉丽安莫斯的引导下见到了黑客组织的首领摩菲斯劳伦斯费许本，三人一起走上了抗争“矩阵”的征途。 “尼奥，你曾经作过这样的梦吗，你坚信不移的东西都是真的吗？你能从那样的梦中醒来吗？你能分辨出梦境与现实世界的区别吗？”尼奥不顾一切地想追寻“矩阵”的真相，他在梦中总是听到关于它的耳语，这是一种神秘的不可知的东西，他清楚地感觉到自己正在受它的控制。 “矩阵是什么？”尼奥不知道，但是他相信摩菲斯这个在传说中被描绘成非常危险人物的黑客能够给他答案。 摩菲斯：“没有人能够说明矩阵是什么，你只有亲自去看。” 尼奥面对着另外一个问题：他就是它吗？虽然不知道为什么，尼奥的答案就是“不是”。摩菲斯的朋友塞弗同意他的观点。而其他人则不那么肯定。 另外，还有人在保护“矩阵”，冷酷的史密斯探员一伙掌握着令人震惊的秘密。 尼奥、默菲和特莱妮必须用他们的生命对抗强大的敌人来追寻答案、寻找自我。 他们的每一步都是危机四伏

面对如潮的电子乌贼，人类城市危在旦夕，墨菲斯和崔妮蒂等欲与入侵者决一死战。此时，“救世主”尼奥的身体和思想却意外分离，后者再度陷入到“母体”中。墨菲斯和崔妮蒂也不得不带着尼奥的身体，回到“母体”和守护天使一起寻找他。一场大战之后，守护天使、病毒双胞胎等皆阵亡，而尼奥却在找到先知之后一无所获……锡安的局势越来越危险，议员及指挥官相继阵亡，机器的攻击却丝毫没有因为人类的反抗而减弱。此时，被叛徒射瞎双眼的尼奥，依然想通过希望去实现预言。这时，特工史密斯控制了先知，并变得越来越强大，威胁到了整个“母体”的稳定。在返回锡安的途中，飞船遭到电子乌贼的突袭，崔妮蒂死了，重伤的尼奥被带到机器城市01。在和机器的谈判中，尼奥答应为了人类和机器的共同利益，去消灭史密斯。于是，“母体”又面临着一次翻天覆地的“重载”……

上回说到NEO同学终于意识到自己的能力和使命，在中弹“复活”的同时，他也变成了无所不能“救世主”。结尾的“飞升”象征着人类超级英雄的诞生：NEO将带领锡安基地安基地的人民，打响对机器世界的反击战，并将以胜利者的姿态结束这场战斗，还人类以自由之身。他的使命会实现吗？矩阵会那么甘心被摧毁吗？

证券交易所内，林艺正在大户室盯着股票k线焦急的关注着，股民们有兴奋有苦恼，一如往日的喧嚣，突然间所有电脑都停顿了，引起一阵很大的骚动，五分钟之后一切恢复正常！ 各大政府，银行都在使用一种高端防御系统：网盾软件，以防止黑客的攻击和系统的正常运行！这个被御为目前最安全的防御软件正在面临一场毁灭性的灾害... 这次的事故引起了网络警察刘惠的关注，她发现网盾公司的林艺账户被莫名账户转账一千万元，网盾公司CEO司马教授也因此知道了林艺在挪用公款，可是事情还远远没有结束... 高宇制造了一个黑客程序，破解了网盾的防御，即将在24小时后袭击整个政府和银行系统，这将对社会造成巨大的损失！刘惠经过努力终于与高宇取得联系，却被告知需要完成三道问题，方能阻止一切发生，这期间司马教授的女儿被黑社会老大陈力绑架...此时司马教授才终于说出高宇的身份和他此次的目的，当刘惠将他的故事发到网上之后，却被高宇将隐藏了三年的尘封往事与一切事情起因的原由揭露了出来...司马教授、陈力、林艺、高宇到底谁才是最终的罪犯，是谁引起了一切灾难？ 孰对孰错，报复与信任，宽恕与谅解，一场亦正亦邪，警察与罪犯的较量，良心与背叛的拷问，即将展开...